A geração de microbolhas funciona através de uma bomba que recalca uma porcentagem da água já tratada do tanque de flotação para um vaso pressurizador. Através de um compressor, é adicionado ar comprimido ao vaso para realizar a mistura do ar com a água, garantindo sua dissolução.
A água saturada percorre pela tubulação até chegar na válvula de descompressão. Na descompressão, o ar dissolvido expande e se transforma nas microbolhas que logo em seguida misturam-se com o efluente que vem do sistema de floculação. As microbolhas se prendem aos flocos de partículas sólidas, diminuindo sua densidade e as elevando até a superfície, onde se forma uma massa que será removida através do raspador. O controle da injeção de ar é feito através de um sistema automático composto por rotâmetro, válvula solenoide e boias de nível.